从python中的VTK文件中检索facet和point

2019年7月28日 221次阅读

我有一个包含3d模型的vtk文件,

我想提取点坐标和刻面.

这是一个最小的工作示例：

import vtk
import numpy
from vtk.util.numpy_support import vtk_to_numpy

reader = vtk.vtkPolyDataReader()
reader.SetFileName('test.vtk')
reader.Update()

polydata = reader.GetOutput()

points = polydata.GetPoints()
array = points.GetData()
numpy_nodes = vtk_to_numpy(array)

这可以作为numpy_nodes包含所有点的x,y,z坐标,但我无法检索将此模型的方面与相应点相关联的列表.

我试过了：

facets= polydata.GetPolys()
array = facets.GetData()
numpy_nodes = vtk_to_numpy(array)

但是numpy_nodes只是一个一维数组,我期望一个二维数组(大小为3 *小平面的数量),其中第一个维度包含facet对应点的数量(如.ply文件中).

任何有关如何进行的建议都将受到欢迎

最佳答案 你快到了.为了允许不同类型的单元格(三角形,四边形等),numpy数组使用以下方案对信息进行编码：

numpyArray = [ n_0, id_0(0), id_0(1), ..., id_0(n0-1), 
               n_1, id_1(0), id_1(1), ..., id_1(n1-1), 
               ... 
               n_i, id_i(0), id_i(1), ..., id_1(n1-1), 
               ...
              ]

如果所有多边形都是同一类型,对于所有i来说都是n_i == n,只需重新整形1D数组以获得可解释的内容：

cells = polydata.GetPolys()
nCells = cells.GetNumberOfCells()
array = cells.GetData()
# This holds true if all polys are of the same kind, e.g. triangles.
assert(array.GetNumberOfValues()%nCells==0)
nCols = array.GetNumberOfValues()//nCells
numpy_cells = vtk_to_numpy(array)
numpy_cells = numpy_cells.reshape((-1,nCols))

可以删除numpy_cells的第一列,因为它只包含每个单元格的点数.但其余列包含您要查找的信息.

为了确保结果,请将输出与“传统”方法进行比较以收集点ID：

def getCellIds(polydata):
    cells = polydata.GetPolys()
    ids = []
    idList = vtk.vtkIdList()
    cells.InitTraversal()
    while cells.GetNextCell(idList):
        for i in range(0, idList.GetNumberOfIds()):
            pId = idList.GetId(i)
            ids.append(pId)
    ids = np.array(ids)
    return ids

numpy_cells2 = getCellIds(polydata).reshape((-1,3))

print(numpy_cells[:10,1:])
print(numpy_cells2[:10])
assert(np.array_equal(numpy_cells[:,1:], numpy_cells2))
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