基于转录组测序获得的定量表达值,识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子,实际上方法还是非常多的。但就目前来看,DESeq2和edgeR是出现频率最高的两种方法了。 DESeq2已经在上一篇文章中作了简介,本篇继续展…
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edger多组差异性分析_简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析
DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析,主要也是用于RNA-Seq数据,同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。 这两个都属于R包,其相同点在于都是对count data数据进行处理,都…