从gdc-client下载数据后，接下来，我们可以尝试把gdc数据转化为基因表达矩阵，这里需要对原始数据文件进行加工处理 1.准备工作 创建一个工作目录，将样本文件夹放在all文件夹下 在本地选择一个文件夹：f:/gdc…

edgeR edgeR是非常经典的转录组表达差异分析软件。 样本量：72个转录组样本 library(edgeR) library(HTSFilter) fc <- read.table('counts.txt',…

有些软件安装需要在Java环境下安装，这时候首先要判断一下自己的电脑上是否安装Java。 我的电脑系统版本是Windows7，就以次为例： 1.点击win7的开始菜单 ，在“搜索程序和文件”中输入“cmd” 2.点击“c…

R Perl Linux Python 感谢每一位整理该资料的创作者。这无疑是学习特别是独自摸索生信技能者的福音。 欢迎关注生信技能树，交流和学习。我也是初学者，我将持续深入学习生信的一切，欢迎交流哈——

这其实是上周周末学习的东西，但是我个人是没有做电子文档记录的习惯，一直习惯用word归类文档。但发现自从正儿八经接触服务器，接触linux操作系统之后，用这个网上的文档记录是最方便的。 大神们一般使用博客 比如： 生信菜…

刘小泽写于18.12.2 这个周末做了不少事，参加了P4 China精准医疗会议，第一次参加这种国际性会议，长了不少见识，同时带回来很厚一摞“背景知识” 来学习（各个公司的手册，这个词是和jimmy学的😂…