比较常见三种医学图像分别是:DICOM、Nrrd、Nifti
以下关于用python库读入三类文件
- DICOM
pydicom
import pydicom as dicom
#将每一个DICOM文件读入到slices
slices = [dicom.read_file(path+"\\"+s) for s in os.listdir(path) if s.endswith("DCM")]
# 读取每一个文件数据部分,此时image为ndarray
image = np.stack([s.pixel_array for s in scans], axis = -1)
- Nrrd
nrrd
import nrrd
#nrrd 文件包含数据部分与源文件部分,元文件部分包含解剖系坐标信息
nrrd_data, nrrd_options = nrrd.read(path)
- Nitfi
nibabel
import nibabel as nib
#读取nii文件
data = nib.load(path)
#读取nii文件数据部分
img = data1.get_data()
#——#