模糊C均值聚类算法(FCM)

一、算法描述

模糊聚类算法是一种基于函数最优方法的聚类算法,使用微积分计算技术求最优代价函数.在基于概率算法的聚类方法中将使用概率密度函数,为此要假定合适的模型.模糊聚类算法中向量可以同时属于多个聚类,从而摆脱上述问题.在模糊聚类算法中,定义了向量与聚类之间的近邻函数,并且聚类中向量的隶属度由隶属函数集合提供.对模糊方法而言,在不同聚类中的向量隶属函数值是相互关联的.硬聚类可以看成是模糊聚类方法的一个特例。

设被分类的对象的集合为:X={ 1, 2,⋯, XN},其中每一个对象 有rt个特性指标,设为= ( 1 , 2,⋯,Xnk)T,如果要把X分成c类,则它的每一个分类结果都对应一个 c×N阶的Boolean矩阵U=[M ]Ⅳ,对应的模糊c划分空间为: 

∑M =1,v k;0<∑M ,v i}在此空间上, 模糊c均值算法如下: 

Repeat for 1=1,2⋯⋯ 

Step 1:compute the cluster prototypes(means) Step 2:compute the distance:  Step 3:Update the partition matrix: 

二、算法代码

function [center, U, obj_fcn] = FCMClust(data, cluster_n,options)  % FCMClust.m  采用模糊C均值对数据集data聚为cluster_n类   % 用法:  %  1.  [center,U,obj_fcn] =FCMClust(Data,N_cluster,options);  %  2.  [center,U,obj_fcn] = FCMClust(Data,N_cluster);  %输入:  %   data  —- nxm矩阵,表示n个样本,每个样本具有m的维特征值 %   N_cluster   —-标量,表示聚合中心数目,即类别数  %   options    —- 4×1矩阵,其中  %      options(1): 隶属度矩阵U的指数 (缺省值: 2.0)  %      options(2):  最大迭代次数  %      options(3):  隶属度最小变化量,迭代终止条件(缺省值: 1e-5)  %      options(4): 每次迭代是否输出信息标志 (缺省值: 1)  %输出:  %     center     —- 聚类中心  %     U            —- 隶属度矩阵 %     obj_fcn    —- 目标函数值  %   Example:  %      data = rand(100,2);  %      [center,U,obj_fcn] = FCMClust(data,2);  %      plot(data(:,1),data(:,2),’o’);  %      hold on;  %      maxU = max(U);  %      index1 = find(U(1,:) ==maxU);  %      index2 = find(U(2,:) == maxU);  %      line(data(index1,1),data(index1,2),’marker’,’*’,’color’,’g’);  %      line(data(index2,1),data(index2,2),’marker’,’*’,’color’,’r’);  %      plot([center([1 2],1)],[center([1 2],2)],’*’,’color’,’k’)  %      hold off; %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%  

if nargin~= 2 & nargin ~= 3,   %判断输入参数个数只能是2个或3个         error(‘Too many or too few input arguments!’); end       data_n= size(data, 1); % 求出data的第一维(rows)数,即样本个数  in_n = size(data, 2);  % 求出data的第二维(columns)数,即特征值长度  % 默认操作参数 default_options = [2;  % 隶属度矩阵U的指数    100;  % 最大迭代次数     1e-5; % 隶属度最小变化量,迭代终止条件   1];  % 每次迭代是否输出信息标志       

if nargin== 2,         options =default_options;   else           %分析有options做参数时候的情况        % 如果输入参数个数是二那么就调用默认的option;         if length(options) < 4,%如果用户给的opition数少于4个那么其他用默认值;                 tmp = default_options;      
tmp(1:length(options)) = options;       
options = tmp;         end    %返回options中是数的值为0(如NaN),不是数时为1         nan_index = find(isnan(options)==1);    %将denfault_options中对应位置的参数赋值给options中不是数的位置.         options(nan_index) =default_options(nan_index);        if options(1) <= 1, %如果模糊矩阵的指数小于等于1        
error(‘Theexponent should be greater than 1!’);         end end %将options 中的分量分别赋值给四个变量;  expo =options(1);         % 隶属度矩阵U的指数 max_iter = options(2);     % 最大迭代次数   min_impro =options(3);     % 隶属度最小变化量,迭代终止条件 display = options(4);      % 每次迭代是否输出信息标志        obj_fcn =zeros(max_iter, 1);   % 初始化输出参数obj_fcn       U =initfcm(cluster_n, data_n);     %初始化模糊分配矩阵,使U满足列上相加为1, 

% Main loop  主要循环  for i =1:max_iter,         %在第k步循环中改变聚类中心ceneter,和分配函数U的隶属度值;         [U, center, obj_fcn(i)] = stepfcm(data, U,cluster_n, expo);          if display,        
fprintf(‘FCM:Iteration count =%d, obj. fcn = %f\n’, i, obj_fcn(i));         end    %终止条件判别          if i > 1,       
if abs(obj_fcn(i) – obj_fcn(i-1)) <min_impro,            
    break;        
end,         end end      iter_n = i; % 实际迭代次数  obj_fcn(iter_n+1:max_iter) = [];     

%%%%%%%%%%%%%%%%%% 子函数1 function U = initfcm(cluster_n, data_n)  % 初始化fcm的隶属度函数矩阵  %输入:  %   cluster_n   —- 聚类中心个数  %   data_n     —- 样本点数  % 输出:  %   U         —- 初始化的隶属度矩阵 

U =rand(cluster_n, data_n);  col_sum = sum(U);  U =U./col_sum(ones(cluster_n, 1), :);

%%%%%%%%%%%%%%%%%% % 子函数2 function [U_new, center, obj_fcn] = stepfcm(data, U, cluster_n,expo)  % 模糊C均值聚类时迭代的一步  % 输入:  %   data      —- nxm矩阵,表示n个样本,每个样本具有m的维特征值  %   U          —- 隶属度矩阵 %   cluster_n   —-标量,表示聚合中心数目,即类别数  %   expo       —-隶属度矩阵U的指数                     % 输出:  %   U_new       —-迭代计算出的新的隶属度矩阵  %   center     —- 迭代计算出的新的聚类中心  %  obj_fcn    —- 目标函数值 

mf = U.^expo;      % 隶属度矩阵进行指数运算结果  center =mf*data./((ones(size(data, 2), 1)*sum(mf’))’); % 新聚类中心(5.4)式  dist =distfcm(center, data);      % 计算距离矩阵  obj_fcn = sum(sum((dist.^2).*mf)); % 计算目标函数值 (5.1)式  tmp = dist.^(-2/(expo-1));      U_new =tmp./(ones(cluster_n, 1)*sum(tmp));  % 计算新的隶属度矩阵(5.3)式

%%%%%%%%%%%%%%%%% % 子函数3 function out = distfcm(center, data)  % 计算样本点距离聚类中心的距离  % 输入:  %  center    —- 聚类中心  %   data      —- 样本点  % 输出:  %  out       —- 距离  out =zeros(size(center, 1), size(data, 1));  for k = 1:size(center, 1),      %对每一个聚类中心          %每一次循环求得所有样本点到一个聚类中心的距离          out(k,:) = sqrt(sum(((data-ones(size(data,1),1)*center(k,:)).^2)’,1)); end 

    原文作者:聚类算法
    原文地址: https://blog.csdn.net/zziahgf/article/details/21024085
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