【r<-方案】Ubuntu安装MySQL并与R连接

2024年1月16日 175次阅读来源: 王诗翔

在终端运行下面几条命令安装MySQL：

sudo apt-get install mysql-server
sudo apt-get install mysql-client
sudo apt-get install libmysqlclient-dev

检查mysql是否已经安装好：

sudo netstat -tap | grep mysql

如果看到有mysql 的socket处于 listen 状态则表示安装成功。

安装【方案】Python的mysql驱动连不上数据库修改root验证方式和密码。

在R中安装RMySQL包：

>install.packages("RMySQL")

下面进行测试：

> library(RMySQL)
Loading required package: DBI
> con <- dbConnect(MySQL(),username='root',password='***')
> DBI::dbGetInfo(con)
$host
[1] "localhost"

$user
[1] "root"

$dbname
[1] ""

$conType
[1] "Localhost via UNIX socket"

$serverVersion
[1] "5.7.25-0ubuntu0.18.04.2"

$protocolVersion
[1] 10

$threadId
[1] 4

$rsId
list()

几个操作都没有报错，没有问题。只要稍微改动下密码，就会抛出错误：

> con <- dbConnect(MySQL(),username='root',password='**')
Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Access denied for user 'root'@'localhost' (using password: YES)

在使用ip进行连接时发现一直报错：

Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Can't connect to MySQL server on '10.19.26.41' (36)

百度谷歌了一堆，大都不相干。最后发现是因为mysql为了安全起见，默认使用127.0.0.1，我们将/etc/mysql/mysql.conf.d/mysqld.cnf中的bind_address=127.0.0.1注释掉即可。注意，要重启mysql（service mysql restart）。

mysqldump 是采用SQL级别的备份机制，它将数据表导成 SQL 脚本文件，在不同的 MySQL 版本之间升级时相对比较合适，这也是最常用的备份方法。

示例：

mysqldump -uroot -p database table > /home/jobs/back.sql