python – 使用pandas识别连续的NaN

2023年7月7日 218次阅读

我正在阅读一堆CSV文件(水位随时间变化的测量数据),对它们进行各种分析和可视化.

由于我无法控制的各种原因,这些时间序列通常会丢失数据,所以我做了两件事：

我总计算他们

Rlength=len(RainD)   #counts everything, including NaN
Rcount=RainD.count() #counts only valid numbers
NaN_Number=Rlength-Rcount

如果我有比特定阈值更多的缺失数据,则丢弃数据集：

Percent_Data=Rlength/100
Five_Percent=Percent_Data*5
if NaN_Number > Five_Percent:
    ...

如果NaN的数量足够小,我想填补空白

RainD.level=RainD.level.fillna(method='pad',limit=2)

现在问题是：它的月度数据,所以如果我有超过2个连续NaN,我也想丢弃数据,因为这意味着我“猜测”整个赛季,甚至更多.

documentation for fillna并没有真正提到当连续NaN超过我指定的限制= 2时会发生什么,但当我在…之前和之后查看RainD.describe()时…并将其与基本CSV进行比较,很明显它填充了前2个NaN,然后​​将其余部分保留原样,而不是错误输出.

所以,长话短说：

如何用熊猫识别一些连续的NaN,没有一些复杂和耗时的非熊猫循环？

最佳答案 您可以使用多个布尔条件来测试当前值和先前值是否为NaN：

In [3]:

df = pd.DataFrame({'a':[1,3,np.NaN, np.NaN, 4, np.NaN, 6,7,8]})
df
Out[3]:
    a
0   1
1   3
2 NaN
3 NaN
4   4
5 NaN
6   6
7   7
8   8
In [6]:

df[(df.a.isnull()) & (df.a.shift().isnull())]
Out[6]:
    a
3 NaN

如果您想要找到连续NaN出现在哪里的位置,您可以执行以下操作：

In [38]:

df = pd.DataFrame({'a':[1,2,np.NaN, np.NaN, np.NaN, 6,7,8,9,10,np.NaN,np.NaN,13,14]})
df
Out[38]:
     a
0    1
1    2
2  NaN
3  NaN
4  NaN
5    6
6    7
7    8
8    9
9   10
10 NaN
11 NaN
12  13
13  14

In [41]:

df.a.isnull().astype(int).groupby(df.a.notnull().astype(int).cumsum()).sum()
Out[41]:
a
1    0
2    3
3    0
4    0
5    0
6    0
7    2
8    0
9    0
Name: a, dtype: int32
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