python – 转换网络图形的数据帧

2019年8月3日 234次阅读

我有一个像这样的数据帧：

ID  | Node 1 | Node 2 | Node 3
a   |   1    |    0   |   1
b   |   0    |    1   |   1
c   |   1    |    0   |   0
d   |   1    |    1   |   1
e   |   0    |    1   |   1

我想更改它,以便我可以将其转换为网络图表,其中节点之间的连接是指示两者的ID的次数：

Node A | Node B | Weight |
Node 1 | Node 2 |    1   |
Node 1 | Node 3 |    2   |
Node 2 | Node 3 |    3   |

最佳答案 建于
Tai’s solution,

你可以使用获得所需的DataFrame

import numpy as np
import pandas as pd

def get_weights(df):
    df2 = df.filter(regex='Node')
    nodes = df2.columns
    arr = df2.values
    m = np.dot(arr.T, arr).astype(float)
    idx = np.tril_indices(m.shape[0])   
    m[idx] = np.nan
    result = pd.DataFrame(m, columns=nodes, index=nodes)
    result = result.stack()
    result = result.astype(int)
    result = result.reset_index()
    result.columns = ['Node A', 'Node B', 'Weights']
    return result

df = pd.DataFrame({'ID': ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'],
 'Node 1': [1, 0, 1, 0, 0],
 'Node 2': [0, 1, 0, 1, 1],
 'Node 3': [1, 1, 0, 1, 1]})
result = get_weights(df)
print(result)

产量

   Node A  Node B  Weight
0  Node 1  Node 2       1
1  Node 1  Node 3       2
2  Node 2  Node 3       3
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