我喜欢在多个细节层面上提供研究的想法,即抽象的随意好奇,全文更感兴趣,最后是那些在同一区域工作的数据和代码/试图重现你的结果.在实际文本和数据/代码级别之间,我想插入另一个图层.也就是说,我想创建一种自动生成的附录,其中包含分析中的完整回归输出,诊断图,探索图数据配置文件等,无论
这些情节/回归等是否成为最终论文.
我的一个想法是编写一个脚本来检查.Rnw文件并自动:
>配置所有加载的数据集(有点像Hmisc(?)包)
>总结所有回归 – 即所有模型的运行摘要(模型)
>展示所有情节(无论是否在最终版本中制作)
我们的想法是制作这种低功耗的按钮式的东西,而不是像纸张的其余部分那样编写的正式附录.我正在寻找的是关于如何以相对简单的方式在R中执行此操作的一些想法.我的预感是有一些方法可以通过命名空间,弄清楚是什么,然后转储到PDF中.
思考?这样的事情已经存在吗?
最佳答案 我们用最近的JASA文章:
http://hdl.handle.net/1902.1/12174对此进行了尝试.您应该能够“制作”整篇论文.关于我们的复制存档有一点需要注意:我们使用的R软件包的打包版本.事实证明,随着人们改进他们的包裹,有时他们会改变默认值 – 这会破坏我们的构建.也许将来可能会分发一个包含R二进制文件的整个虚拟机,这个虚拟机将被调用[回忆圆(x,digits =)丢失其参数并成为从R版本到下一个版本的位置 – 进行回合(数字=, x)在没有警告的情况下提供无意义的结果?].
无论如何,这是我们对这样一个复杂文件的第一次尝试.我在这里有一个较小的版本http://hdl.handle.net/1902.1/13376,它不使用make.