如何在R中仅绘制大型社区/群集

我有一个igraph.由于图表很大,我只想绘制超过10个成员的社区,但我想将它们全部绘制在一个图中.

我删除不需要的元素的想法是:

g <- delete_vertices(g, V(g)[igraph::clusters(g)$csize < 10])

但由于某些原因,这会绘制很多单个节点,这与我试图实现的相反.你能告诉我哪里错了吗?

最佳答案 你的想法很棒,但问题是

igraph::clusters(g)$csize < 10

仅返回包含少于10个成员的聚类的逻辑向量.同时,您需要知道哪些顶点属于这些簇.

因此,我们可以如下进行.

set.seed(1)
g1 <- erdos.renyi.game(100, 1 / 70)
cls <- clusters(g1)
cls$csize
#  [1]  1  1 43  2 11  1  1  1  2  1  2  5  1  1  4  4  1  1  1  1  2  1  2  1
# [25]  4  1  1  1  1  1 # Two clusters of interest
g2 <- delete_vertices(g1, V(g1)[cls$membership %in% which(cls$csize <= 10)])
plot(g2)

《如何在R中仅绘制大型社区/群集》

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