将方形加权邻接矩阵转换为R中的igraph对象

2019年7月28日 221次阅读

我使用tf_idf值来确定网页之间的相似性.现在我的tf_idf矩阵不是正方形,因为有很多关键字但只有36个文档.我想将此矩阵转换为图形对象,以便我可以采用一种模式投影相同.

所以我正在使用它
    ig< – graph.adjacency(tf_idf,mode =“undirected”,weighted = TRUE).我想要加权,这是它的tf_idf值. 但是,当我这样做时,它会抛出错误, graph.adjacency.dense出错(adjmatrix,mode = mode,weighted = weighted,：不是方阵 你能帮我决定如何继续. 我有这样的矩阵,其中x,y,z是关键字,A,b是网页

mat = matrix(c(0.1, 0.5, 0.9, 0.4, 0.3, 0.5), nc=3,
           dimnames=list(c("A", "B"), c("x", "y", "z")),
           byrow=TRUE)

      x    y   z
A     0.1 0.5 0.9
B     0.4 0.3 0.5

最佳答案 可能有更好的方法,但如果要将矩阵扩展为完整的邻接矩阵,可以使用以下函数：

expand.matrix <- function(A){
  m <- nrow(A)
  n <- ncol(A)
  B <- matrix(0,nrow = m, ncol = m)
  C <- matrix(0,nrow = n, ncol = n)
  cbind(rbind(B,t(A)),rbind(A,C))
}

例如：

 A <- rbind(c(0,1,0),c(1,0,1))
> A
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    0    1    0
[2,]    1    0    1
> expand.matrix(A)
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    0    0    0    1    0
[2,]    0    0    1    0    1
[3,]    0    1    0    0    0
[4,]    1    0    0    0    0
[5,]    0    1    0    0    0
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