在连续内存分配的情况下,乘以大矩阵要慢得多

2019年7月28日 159次阅读

在实现神经网络时,我注意到如果我将内存分配为数据集阵列的单个连续块,则执行时间会增加几倍.

比较这两种内存分配方法：

float** alloc_2d_float(int rows, int cols, int contiguous)
{
    int i;
    float** array = malloc(rows * sizeof(float*));

    if(contiguous)
    {
        float* data = malloc(rows*cols*sizeof(float));
        assert(data && "Can't allocate contiguous memory");

        for(i=0; i<rows; i++)
            array[i] = &(data[cols * i]);
    }
    else
        for(i=0; i<rows; i++)
        {
            array[i] = malloc(cols * sizeof(float));
            assert(array[i] && "Can't allocate memory");
        }

    return array;
}

以下是使用-march = native -Ofast(尝试gcc和clang)进行编译时的结果：

michael@Pascal:~/NN$time ./test 300 1 0

Multiplying (100000, 1000) and (300, 1000) arrays 1 times, noncontiguous memory allocation.

Allocating memory:    0.2 seconds
Initializing arrays: 0.8 seconds
Dot product:         3.3 seconds

real    0m4.296s
user    0m4.108s
sys     0m0.188s

michael@Pascal:~/NN$time ./test 300 1 1

Multiplying (100000, 1000) and (300, 1000) arrays 1 times, contiguous memory allocation.

Allocating memory:    0.0 seconds
Initializing arrays: 40.3 seconds
Dot product:         13.5 seconds    

real    0m53.817s
user    0m4.204s
sys     0m49.664s

这是代码：
https://github.com/michaelklachko/NN/blob/master/test.c

请注意,对于连续内存,初始化和点积都要慢得多.

我预计相反 – 一个连续的内存块应该比大量独立的小块更加缓存友好.或者至少它们的性能应该相似(这台机器有64GB的RAM,其中90％未使用).

编辑：这是压缩的自包含代码(我仍然建议使用github版本,它具有测量和格式化语句)：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <time.h>

float** alloc_2d_float(int rows, int cols, int contiguous){
    int i;
    float** array = malloc(rows * sizeof(float*));
    if(contiguous){
        float* data = malloc(rows*cols*sizeof(float));
        for(i=0; i<rows; i++)
            array[i] = &(data[cols * i]);
    }
    else
    for(i=0; i<rows; i++)
        array[i] = malloc(cols * sizeof(float));
    return array;
}

void initialize(float** array, int dim1, int dim2){
    srand(time(NULL));
    int i, j;
    for(i=0; i<dim1; i++)
        for(j=0; j<dim2; j++)
            array[i][j] = rand()/RAND_MAX;
}

int main(){
    int i,j,k, dim1=100000, dim2=1000, dim3=300;
    int contiguous=0;
    float temp;

    float** array1 = alloc_2d_float(dim1, dim2, contiguous);
    float** array2 = alloc_2d_float(dim3, dim2, contiguous);
    float** result = alloc_2d_float(dim1, dim3, contiguous);

    initialize(array1, dim1, dim2);
    initialize(array2, dim3, dim2);

    for(i=0; i<dim1; i++)
        for(k=0; k<dim3; k++){
            temp = 0;
            for(j=0; j<dim2; j++)
                temp += array1[i][j] * array2[k][j];
            result[i][k] = temp;
    }
}

最佳答案 看起来您已经遇到编译器的能力或残疾,无法运行代码的矢量化.

我试图重复你的实验没有成功 –

mick @ mick-laptop：〜/Загрузки$./ a.out 100 1 0

将(100000,1000)和(100,1000)个数组相乘1次,不连续
  内存分配.

初始化数组……

乘法数组……

执行时间处理时间：
  分配记忆：0.1秒
  初始化数组：0.9秒
  点积：44.8秒

mick @ mick-laptop：〜/Загрузки$./ a.out 100 1 1

将(100000,1000)和(100,1000)个数组相乘1次,连续
  内存分配.

初始化数组……

乘法数组……

执行时间处理时间：
  分配内存：0.0秒
  初始化数组：1.0秒
  点积：46.3秒

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