我画了这样的热图:
ggplot(test, aes(start1, start2)) +
geom_tile(aes(fill = logFC), colour = "gray", size=0.05) +
scale_fill_gradientn(colours=c("#0000FF","white","#FF0000"), na.value="#DAD7D3")
这绘制了热图的上三角形.我想绘制的是相同的三角形,但是将斜边作为x轴.
我该怎么办?
编辑:添加了可重复的示例
library(ggplot2)
# dummy data
df1 <- mtcars[, c("gear","carb", "mpg")]
# normal tile plot
gg1 <- ggplot(df1, aes(gear, carb, fill = mpg)) +
geom_tile() +
xlim(c(1, 10)) +
ylim(c(1, 10)) +
theme_void() +
theme(legend.position = "none")
预期输出(手动旋转):
使用基础图像()的相关文章:
Visualising and rotating a matrix
可能的解决方案示例代码是在LDheatmap package使用网格.
最佳答案 使用
this solution将输出剪切到底部,因此解决方法是添加额外的绘图边距然后使用grid :: viewport()来旋转:
library(ggplot2) #ggplot2_2.2.1
library(grid)
gg1 <- ggplot(df1, aes(gear, carb, fill = mpg)) +
geom_tile() +
xlim(c(1, 10)) +
ylim(c(1, 10)) +
theme_void() +
# add extra margins
theme(legend.position = "none",
plot.margin = unit(c(1, 1, 1, 1), "cm"))
# then rotate
print(gg1, vp = viewport(angle = 45))