python – 使用另一个cython模块导入cython模块时未定义的符号

2019年7月20日 199次阅读

我正在使用Cython将一组C函数包装到模块中.我希望能够将第一个模块导入到后续的基于Cython的项目中,但是当我在
python脚本中导入衍生模块时,我遇到了一个“未定义的符号”问题.

考虑以下在不同目录中开发的两个模块的最小工作示例：

# exModA wraps the functions provided in exModAFxn.c
exModA/
    __init__.pxd
    __init__.py
    exModAFxn.c
    exModA.pyx
    setup.py
# exModB attempts to use the cdef functions from exModA
exModB/
   __init__.py
   exModB.pyx
   setup.py
# The test script attempts to make use of exModB
test.py

.exModA / __ __初始化PXD：

cdef extern void myCMessage()

exModA / __ init__.py：

from exModA import *

exModA / exModAFxn.c：

#include <stdio.h>
void myCMessage() { printf( "This is a test!\n" ); }

exModA / exModA.pyx：

cdef extern from "exModAFxn.c" :
    void myCMessage()
# Use myCMessage in a python function
def foo() :
    myCMessage()

exModA / setup.py：

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
setup( 
    name = 'exModA',
    ext_modules = cythonize( ['exModA/exModA.pyx'] ),
)

exModB / __ init__.py：

from exModB import *

exModB / exModB.pyx：

cimport exModA
# Use a cdef function from exModA in a python function
def bar() :
    exModA.myCMessage()

exModB / setup.py：

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
setup( 
    name = 'exModB',
    ext_modules = cythonize( ['exModB/exModB.pyx'] ),
)

编译两个cython模块后调用test.py脚本.

python extModA/setup.py build_ext --inplace
python extModB/setup.py build_ext --inplace

test.py：

import exModA
exModA.foo()    # successfully prints message
import exModB   # raises ImportError: undefined symbol: myCMessage
exModB.bar()    # we never get to this line :(

从exModA.foo函数成功打印消息向我建议myCMessage实际上是可用的,但是在导入exModB时找不到它.我知道如果我将exModA和exModB合并到一个项目中,这个问题就会消失,但我想尽可能避免这种方法 – 我正在尝试为一个C库公开一组通用的包装器,以便在几个不同的项目中使用应用.

最佳答案 通过执行以下操作,我能够使其工作：

首先,在exModB / setup.py文件中指定exModA库以进行链接,如下所示：

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize

ext = Extension('exModB/exModB',
                sources=['exModB/exModB.pyx'],
                libraries=['exModA'],
                library_dirs=['/home/MyFolder/exModA'],
                runtime_library_dirs=['/home/MyFolder/exModA']
                )
setup(name='exModB', ext_modules = cythonize(ext))

(我建议不要指定运行时库目录,而是将exModA.so移动到库搜索路径上的文件夹中.)

我还必须将exModA.so重命名为libexModA.so,以便gcc可以找到它.在构建exModA.so之后,但在构建exModB.so之前执行此操作：

python exModA/setup.py build_ext --inplace
cp exModA/exModA.so exModA/libexModA.so
python exModB/setup.py build_ext --inplace

你可能想要调整它,但它应该让你开始.

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