按形状,颜色和填充的R散点图

2019年7月20日 428次阅读

我是R的新手,我正在尝试建立一个散点图,根据形状,颜色和填充来编码我的数据.我想要5种不同的颜色,3种不同的形状,这些要么是填充的还是未填充的(在一个非填充点,我仍然想要形状和颜色).

我的数据基本上看起来像这样：

blank.test <- read.table(header=T, text="Colour Shape Fill X13C X15N
1       B     B    A   16   10
2       D     A    A   16   12
3       E     A    B   17   14
4       C     A    A   14   18
5       A     A    B   13   18
6       C     B    B   18   13
7       E     C    B   10   12
8       E     A    B   11   10
9       A     C    B   14   13
10      B     A    A   11   14
11      C     B    A   11   10
12      E     B    A   11   19
13      A     B    A   10   18
14      A     C    B   17   16
15      E     B    A   16   13
16      A     C    A   16   14")

如果我这样做：

ggplot(blank.test, aes(x=X13C, y=X15N,size=5)) + 
                    geom_point(aes(shape=Shape,fill=Fill,color=Colour))

我没有填充或未填充的数据点

《按形状,颜色和填充的R散点图》

我做了一点点研究,看起来问题是符号本身,它不能采取不同的线和填充设置;建议我使用21到25之间的形状pch

但如果我这样做：

ggplot(blank.test, aes(x=X13C, y=X15N,color=(Colour), shape=(Shape),fill=(Fill),size=5)) + 
                 geom_point() + scale_shape_manual(values=c(21,22,25))`

我仍然不是我想要的

《按形状,颜色和填充的R散点图》

我也尝试过使用scale_fill_manual而没有任何好结果.

最佳答案 我不认为你可以使用填充积分.我要做的是在填充和形状之间创建一个交互,并使用这个新因子来定义您的形状和填充/打开符号

blank.test$inter <- with(blank.test, interaction(Shape,  Fill))

然后对于你的情节,我会使用类似的东西

ggplot(blank.test, aes(x=X13C, y=X15N)) + 
                    geom_point(aes(shape=inter,color=Colour)) + scale_shape_manual(name="shape", values=c(0,15,1, 16, 2, 17)) + scale_color_manual(name="colour", values=c("red","blue","yellow", "green", "purple"))
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