最近我在维基百科上完成了一些数据挖掘方面的任务。它由这些部分组成:
解析enwiki-pages-articles.xml的维基百科转储;
把类别和页存储到MongoDB里面;
对类别名称进行重新分门别类。
我对CPython 2.7.3和PyPy 2b的实际任务性能进行了测试。我使用的库是:
redis 2.7.2
pymongo 2.4.2
此外CPython是由以下库支持的:
hiredis
pymongo c-extensions
测试主要包含数据库解析,所以我没预料到会从PyPy得到多大好处(何况CPython的数据库驱动是C写的)。
下面我会描述一些有趣的结果。
抽取维基页名
我需要在所有维基百科的类别中建立维基页名到page.id的联接并存储重新分配好的它们。最简单的解决方案应该是导入enwiki-page.sql(定义了一个RDB表)到MySQL里面,然后传输数据、进行重分配。但我不想增加MySQL需求(有骨气!XD)所以我用纯Python写了一个简单的SQL插入语句解析器,然后直接从enwiki-page.sql导入数据,进行重分配。
这个任务对CPU依赖更大,所以我再次看好PyPy。
/ time
PyPy 169.00s 用户态 8.52s 系统态 90% CPU
CPython 1287.13s 用户态 8.10s 系统态 96% CPU
我也给page.id->类别做了类似的联接(我笔记本的内存太小了,不能保存供我测试的信息了)。
从enwiki.xml中筛选类别
为了方便工作,我需要从enwiki-pages-articles.xml中过滤类别,并将它们存储相同的XML格式的类别。因此我选用了SAX解析器,在PyPy和CPython中都适用的包装器解析。对外的原生编译包(同事在PyPy和CPython 中) 。
代码非常简单:
class WikiCategoryHandler(handler.ContentHandler): """Class which detecs category pages and stores them separately """ ignored = set(('contributor', 'comment', 'meta')) def __init__(self, f_out): handler.ContentHandler.__init__(self) self.f_out = f_out self.curr_page = None self.curr_tag = '' self.curr_elem = Element('root', {}) self.root = self.curr_elem self.stack = Stack() self.stack.push(self.curr_elem) self.skip = 0 def startElement(self, name, attrs): if self.skip>0 or name in self.ignored: self.skip += 1 return self.curr_tag = name elem = Element(name, attrs) if name == 'page': elem.ns = -1 self.curr_page = elem else: # we don't want to keep old pages in memory self.curr_elem.append(elem) self.stack.push(elem) self.curr_elem = elem def endElement(self, name): if self.skip>0: self.skip -= 1 return if name == 'page': self.task() self.curr_page = None self.stack.pop() self.curr_elem = self.stack.top() self.curr_tag = self.curr_elem.tag def characters(self, content): if content.isspace(): return if self.skip == 0: self.curr_elem.append(TextElement(content)) if self.curr_tag == 'ns': self.curr_page.ns = int(content) def startDocument(self): self.f_out.write("<root>\n") def endDocument(self): self.f_out.write("<\root>\n") print("FINISH PROCESSING WIKIPEDIA") def task(self): if self.curr_page.ns == 14: self.f_out.write(self.curr_page.render()) class Element(object): def __init__(self, tag, attrs): self.tag = tag self.attrs = attrs self.childrens = [] self.append = self.childrens.append def __repr__(self): return "Element {}".format(self.tag) def render(self, margin=0): if not self.childrens: return u"{0}<{1}{2} />".format( " "*margin, self.tag, "".join([' {}="{}"'.format(k,v) for k,v in {}.iteritems()])) if isinstance(self.childrens[0], TextElement) and len(self.childrens)==1: return u"{0}<{1}{2}>{3}</{1}>".format( " "*margin, self.tag, "".join([u' {}="{}"'.format(k,v) for k,v in {}.iteritems()]), self.childrens[0].render()) return u"{0}<{1}{2}>\n{3}\n{0}</{1}>".format( " "*margin, self.tag, "".join([u' {}="{}"'.format(k,v) for k,v in {}.iteritems()]), "\n".join((c.render(margin+2) for c in self.childrens))) class TextElement(object): def __init__(self, content): self.content = content def __repr__(self): return "TextElement" def render(self, margin=0): return self.content
Element和TextElement元素包换tag和body信息,同时提供了一个方法来渲染它。
下面是我想要的PyPy和CPython比较结果。
/ time
PyPy 2169.90s
CPython 4494.69s
我很对PyPy的结果很吃惊。
计算有趣的类别集合
我曾经想要计算一个有趣的类别集合——在我的一个应用背景下,以Computing类别衍生的一些类别为开始进行计算。为此我需要构建一个提供类的类图——子类关系图。
结构类——子类关系图
这个任务使用MongoDB作为数据来源,并对结构进行重新分配。算法是:
for each category.id in redis_categories (it holds *category.id -> category title mapping*) do: title = redis_categories.get(category.id) parent_categories = mongodb get categories for title for each parent_cat in parent categories do: redis_tree.sadd(parent_cat, title) # add to parent_cat set title
抱歉写这样的伪码,但我想这样看起来更加紧凑些。
所以说这个任务仅把数据从一个数据库拷贝到另一个。这里的结果是MongoDB预热完毕后得出的(不预热的话数据会有偏差——这个Python任务只耗费约10%的CPU)。计时如下:
/ time
PyPy 175.11s 用户态 66.11s 系统态 64% CPU
CPython 457.92s 用户态 72.86s 系统态 81% CPU
遍历redis_tree(再分配过的树)
如果我们有redis_tree数据库,仅剩的问题就是遍历Computing类别下所有可实现的结点了。为避免循环遍历,我们需要记录已访问过的结点。自从我想测试Python的数据库性能,我就用再分配集合列来解决这个问题。
/ time
PyPy 14.79s 用户态 6.22s 系统态 69% CPU 30.322 总计
CPython 44.20s 用户态 13.86s 系统态 71% CPU 1:20.91 总计
说实话,这个任务也需要构建一些tabu list(禁止列表)——来避免进入不需要的类别。但那不是本文的重点。
结论
进行的测试仅仅是我最终工作的一个简介。它需要一个知识体系,一个我从抽取维基百科中适当的内容中得到的知识体系。
PyPy相比CPython,在我这个简单的数据库操作中,提高了2-3倍的性能。(我这里没有算上SQL解析器,大约8倍)
多亏了PyPy,我的工作更加愉悦了——我没有改写算法就使Python有了效率,而且PyPy没有像CPython一样把我的CPU弄挂了,以至于一段时间内我没法正常的使用我的笔记本了(看看CPU时间占的百分比吧)。
任务几乎都是数据库操作,而CPython有一些加速的乱七八糟的C语言模块。PyPy不使用这些,但结果却更快!
我的全部工作需要大量的周期,所以我真高兴能用PyPy。