RDD Join 性能调优

2019年6月8日 150次阅读 来源: 小爷Souljoy

阅读本篇博文时，请先理解RDD的描述及作业调度：[《深入理解Spark 2.1 Core （一）：RDD的原理与源码分析 》]（http://blog.csdn.net/u011239443/article/details/53894611#t16）

Join数据是我们在Spark操作中的很重要的一部分。Spark Core 和Spark SQL的基本类型都支持join操作。虽然join很常用而且功能很强大，但是我们使用它的时候，我们不得不考虑网络传输和所处理的数据集过大的问题。在Spark Core中，DAG优化器不像SQL优化器，它不能够重命令或者下压过滤。所以，Spark操作顺序对于Spark Core显得尤为重要。

《RDD Join 性能调优》 这里写图片描述

这篇博文，我们将介绍RDD类型的join操作。通常来说，join是一中非常昂贵的操作。对于每个child RDD 的partition，它从各个parent RDD 的 各个 partition中，获取到与该child RDD partition上的key相对应的所有值。

假设有两个parent RDD，它们都没有已知的partitioner（可以理解为该RDD到其child RDD 重分区函数），那么它们就需要shuffle，使得它们共享同一个partitioner，并且有着相同key的数据会在同一个partition里面。如上图“join with inputs not co-partitioned”。

若parent RDD有已知的partitioner（若已知的partitioner相同，两个RDD会协同，那么就能避免网络传输，两个parent RDD 的相同partition会在同一个节点上），那么可能如上图的“join with inputs co-partitioned”，只能产生窄依赖。

和大多数的K/V操作一样，随着key的数量的增加和记录之间的距离的增加（需要寻找其所在的partition），join的花费会越来越高。

选择join的类型

默认情况下，Spark只会对两个RDD的key的值进行join。在有多个相同key值的情况下，会生成所有的K/V对。所以，标准join的最好的情况是，两个RDD有相同的key集合，而且该key集合中的key都是互斥的。若有重复的key，数据量会急剧的扩大以至于导致性能问题。若有个key只在一个RDD中出现了，那么你将失去那行数据。所以，有以下几条建议：

  1. 若两个RDD都有有重复的key，join操作会使得数据量会急剧的扩大。所有，最好先使用distinct或者combineByKey操作来减少key空间或者用cogroup来处理重复的key，而不是产生所有的交叉结果。在combine时，进行机智的分区，可以避免第二次shuffle。
  2. 如果只在一个RDD出现，那你将在无意中丢失你的数据。所以使用外连接会更加安全，这样你就能确保左边的RDD或者右边的RDD的数据完整性，在join之后再过滤数据。
  3. 如果我们容易得到RDD的可以的有用的子集合，那么我们可以先用filter或者reduce，如何在再用join。

总之，join通常是你在使用Spark时最昂贵的操作，需要在join之前应尽可能的先缩小你的数据。

假设，你有一个RDD存着（熊猫id，分数），另外一个RDD存着（熊猫id，邮箱地址）。若你想给每只可爱的熊猫的邮箱发送她所得的最高的分数，你可以将RDD根据id进行join，然后计算最高的分数，如下：

def joinScoresWithAddress1( scoreRDD : RDD[(Long, Double)],
addressRDD : RDD[(Long, String )]) : RDD[(Long, (Double, String))]= {
    val joinedRDD = scoreRDD.join(addressRDD)
    joinedRDD.reduceByKey( (x, y) => if(x._1 > y._1) x else y )
}

然而，这可能不会比先减少分数数据的方案快。先计算最高的分数，那么每个熊猫的分数数据就只有一行，接下来再join地址数据：

def joinScoresWithAddress2( scoreRDD : RDD[(Long, Double)],
addressRDD : RDD[(Long, String )]) : RDD[(Long, (Double, String))]= {
    val bestScoreData = scoreRDD.reduceByKey((x, y) => if(x > y) x else y)
    bestScoreData.join(addressRDD)
}

若每个熊猫有1000个不同的分数，那么这种做法的shuffle量就比上一种的小了1000倍。

如果你想要左外连接，保留分数数据中地址数据所没有的熊猫，那么你可以用leftOuterJoin来替代join。Spark还有fullOuterJoin和rightOuter，可以根据你想保留的记录选择使用。丢失的值会以None的形式存在：

def outerJoinScoresWithAddress( scoreRDD : RDD[(Long, Double)],
addressRDD : RDD[(Long, String )]) : RDD[(Long, (Double, Option[String]))]= {
    val joinedRDD = scoreRDD.leftOuterJoin(addressRDD)
    joinedRDD.reduceByKey( (x, y) => if(x._1 > y._1) x else y )
}

选择执行过程

由于join数据时，Spark需要被join的数据在相同的分区。所有，默认实现是进行shuffled hash join。shuffled hash join会将第二个数据集按照第一个数据分区，这么一来有着相同hash值的key就会在相同的分区中了。虽然这种方法有用，但由于它需要shuffle，所以很昂贵。而以下情况可以避免shuffle：

  1. 连个RDD都有已知的partitioner
  2. 其中一个数据足够小到保存到内存这么一来我们就可以使用广播 hash join

注意，若RDD协同了，那么网络传输和shuffle都能避免。

通过分配已知Partitioner来加速Join

Spark是一个分布式的计算引擎，可以通过分区的形式将大批量的数据划分成n份较小的数据集进行并行计算。这种思想应用到Join上便是Shuffle Hash Join了。利用key相同必然分区相同的这个原理，Spark将较大表的join分而治之，先将表划分成n个分区，再对两个表中相对应分区的数据分别进行Hash Join。其原理如下图：

《RDD Join 性能调优》 这里写图片描述

而这仅仅适用于join with inputs co-partitions的情况。当在join with inputs not co-partitions

首先将两张表按照join keys进行了重新shuffle，保证join keys值相同的记录会被分在相应的分区。分区后对每个分区内的数据进行排序，排序后再对相应的分区内的记录进行连接。

但是shuffle操作十分昂贵，为了避免shuffle，我们可以通过使用下面的方案：

如果你在做join之前，其中一个RDD(RDD_A)不得不先进行一个shuffle操作，比如说aggregateByKey或者reduceByKey。你可以将该shuffle操作所使用的partitioner设置为另外一个RDD(RDD_B)的partitioner（若RDD_B的partitioner为None，则根据RDD_Bd的分区数new一个HashPartitioner），并持久化RDD_A，这样一来就可以避免两个RDD join时的shuffle了：

def joinScoresWithAddress3( scoreRDD : RDD[(Long, Double)],
addressRDD : RDD[(Long, String )]) : RDD[(Long, (Double, String))]= {
    val addressDataPartitioner = addressRDD.partitioner match {
      case (Some(p)) => p
      case (None) => new HashPartitioner(addressRDD.partitions.length)
    }
    val bestScoreData = scoreRDD.reduceByKey(addressDataPartitioner, (x, y) => if(x > y) x else y)
    bestScoreData.cache
    bestScoreData.join(addressRDD)
}

建议在重分区后总是进行持久化。

广播 Hash Join

《RDD Join 性能调优》 这里写图片描述

若RDD_B小到足以存到内存，那么我们可以使用广播变量将它push到各个节点。这种方法不需要shuffle，而是RDD_A的各个分区，分别会被RDD_B中相关的值join上，形成Child RDD 对应的分区。有时候Spark会很机智的自动帮你做这件事。

部分手动广播 Hash Join

有时候，我们的RDD_B并不能足够小到都能装进内存，但是有些RDD_A中的key会重复很多次，这时候你就可以想着只广播RDD_B中在RDD_A中出现最频繁的那些值。当一种key值在RDD_A中多到一个partition都装不下时，这种方法会非常有用。在这种情况下，你可以对RDD_A使用countByKeyApprox来近似得到哪些key需要广播。然后，你将从RDD_B中filter出来需要广播的RDD_B_0和不要广播的RDD_B_1，将RDD_B_0 collect成本地的HashMap。使用sc.broadcast广播该HashMap,使得每个节点都有一个备份，与RDD_A手动的执行join,得到结果RDD_C_1。再根据HashMap将RDD_A中多次重复的key值去掉，生成RDD_A_1。对RDD_A_1和RDD_B_1进行标准的join，得到结果RDD_C_0，并unoin上RDD_C_1，得到最终的结果。

这种方法虽然有点复杂，但是在对高度倾斜的数据进行处理时的效果很好。

    原文作者：小爷Souljoy
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