以下的内容非个人原创，来自于网络上资料的整理，主要是stackoverflow。
选择MyISAM的场景[1]
1. 读请求远远大于写请求
2. 低版本的MySQL（小于5.6）需要全文搜索的功能
3. 其他场景下，均推荐使用innodb
区别[2]
1. 锁。MyISAM使用的是表锁，在写比较多得情况下，性能很差；与之对比的，innodb使用的时行级锁(row-locking)，写的并发度较MyISAM好。
2. 事务。MyISAM不支持事务，Innodb则支持
3. 速度。对于“几乎只读”的表，MyISAM速度会更快。
4. 外键。Innodb支持外键。
个人观点
任何软件的使用都是需要看场景的，具体问题具体分析。一般来说，推荐使用Innodb，因为它更像一个现代的数据库。
