使用tabix构建vcf的索引时,遇到失败的问题
tbx_index_build failed: XXX.vcf.gz
是因为这个压缩文件需是用bgzip压缩的,所以正确的使用方法是:
gunzip XXX.vcf.gz
bgzip XXX.vcf
tabix -p vcf XXX.vcf.gz
使用tabix构建vcf的索引时,遇到失败的问题
tbx_index_build failed: XXX.vcf.gz
是因为这个压缩文件需是用bgzip压缩的,所以正确的使用方法是:
gunzip XXX.vcf.gz
bgzip XXX.vcf
tabix -p vcf XXX.vcf.gz