在一个水体上移除部分光栅图像

我正在尝试制作一个带有传单的地图,最终将用于显示在地理区域内插的各种估计值.

我为链接数据道歉.我不够聪明,无法弄清楚如何从Google Docs导入.RData文件.我正在使用的光栅形状可以从https://drive.google.com/file/d/0Bw3leA1Ef_e5RmdKVDNYX0xmS2s/view?usp=sharing下载
(这是与下面使用的Coord,rnew和cleveland对象的更新链接).

我能够得到我想要的地图:

library(tigris) 
library(leaflet)
library(raster)
library(magrittr)
library(dplyr)

load("Coord.Rdata")

rnew <- 
  rasterFromXYZ(
    Coord,
    crs = "+init=epsg:4326 +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0"
  )

pal <- colorNumeric(c("#0C2C84", "#41B6C4", "#FFFFCC"), values(rnew),
                    na.color = "transparent")

leaflet() %>% addTiles() %>%
  addRasterImage(rnew, colors = pal, opacity = 0.4)

哪个产生
《在一个水体上移除部分光栅图像》

现在,就像那样美丽,我对伊利湖的估计显示出来并没有多大意义.我想删除湖面上光栅图像的部分,或者将其设置为透明……不会给人留下我正在计算海洋野生动物风险的印象.

我想如果我能找到俄亥俄州的纬度和经度,我或许可以只使用交叉点,从而去除湖上的点.我试着把它放在一起使用

ohio <- tracts(state = "39")

ohio_raster <- 
  attributes(ohio)$data[, c("INTPTLON", "INTPTLAT")] %>%
  setNames(c("x", "y")) %>%
  mutate(x = sub("^[-]", "", x) %>%
           as.numeric(),
         y = sub("^[+]", "", x) %>%
           as.numeric(),
         layer = 1) %>%
  as.matrix() %>%
  rasterFromXYZ(crs = "+init=epsg:4326 +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0")

但得到了错误

Error in rasterFromXYZ(., crs = “+init=epsg:4326 +proj=longlat
+datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0”) : x cell sizes are not regular

这种作品,但没有颜色,所以我看不到交集

ohio_raster <- 
  raster(ohio, crs = "+init=epsg:4326 +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0")

leaflet() %>% addTiles() %>%
  addRasterImage(rnew, colors = pal, opacity = 0.4) %>%
  addRasterImage(ohio_raster, colors = "red", opacity = .4)

Warning message:
In raster::projectRaster(x, raster::projectExtent(x, crs = sp::CRS(epsg3857))) :
‘from’ has no cell values

(注意:地图缩小到包括整个俄亥俄州)
《在一个水体上移除部分光栅图像》

我还认为如果我使用空间包,可能会计算出交集:

spdf <- 
  SpatialPointsDataFrame(Coord[, 1:2], 
                         Coord,
                         proj = CRS("+init=epsg:4326 +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0"))

ohio_coord <- attributes(ohio)$data[, c("INTPTLON", "INTPTLAT")] %>%
  setNames(c("x", "y")) %>%
  mutate(x = sub("^[-]", "", x) %>%
           as.numeric(),
         y = sub("^[+]", "", x) %>%
           as.numeric(),
         layer = 1) %>%
  as.matrix() %>%
  as.data.frame()

spdf_ohio <- 
  SpatialPointsDataFrame(ohio_coord[, 1:2], 
                         ohio_coord,
                         proj = CRS("+init=epsg:4326 +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0"))

spdf_merge <- merge(spdf, spdf_ohio)

leaflet() %>% addTiles() %>%
  addRasterImage(raster(spdf_merge), colors = pal, opacity = 0.4) 

但我明白了

Warning message: In raster::projectRaster(x, raster::projectExtent(x,
crs = sp::CRS(epsg3857))) : ‘from’ has no cell values

《在一个水体上移除部分光栅图像》

那么,实际的问题是:

>这是解决这个问题的合理方法吗?我错过了更好的方法吗?
>我如何从纬度和经度转到带有值的光栅图像以给出阴影,以便我可以看到我正在使用的是什么?

即使我没有直接回答手头的问题,我也会欣喜若狂地获得一些关于在哪里找到类似问题的例子的指导.我还没有找到类似的东西,这可能是一个不知道正确搜索条件的标志.

编辑:

我觉得我可能更接近一步,但仍然不是那么远.

我根据@IvanSanchez的推荐下载了克利夫兰的地理位置.只需绘制多边形即可.

《在一个水体上移除部分光栅图像》

这看起来像我想要保留的土地空间.这是一个很好的一步.

现在我尝试将其与我当前的栅格相交

cleveland <- 
  readOGR(dsn = "cleveland_ohio.osm2pgsql-shapefiles",
          layer = "cleveland_ohio_osm_polygon",
          p4s = "+init=epsg:4326 +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0")

leaflet() %>% addTiles() %>%
  addRasterImage(raster::intersect(rnew, cleveland), 
                 colors = pal, 
                 opacity = 0.4)

但是,我似乎没有这些领域的交汇点.或者不同的东西.

《在一个水体上移除部分光栅图像》

我已将上面的链接更新为包含Coord,rnew和cleveland对象的文件.

最佳答案 您可以使用表示陆地区域的shapefile屏蔽栅格.您可以使用您的Ohio tract shapefile,但Natural Earth的
lakes data可能会简化操作.例如:

library(leaflet)
library(raster)
library(magrittr)
library(rgdal)
library(rgeos)

load('Coord.Rdata')  
rnew <- rasterFromXYZ(Coord, crs='+init=epsg:4326')
pal <- colorNumeric(c('#0C2C84', '#41B6C4', '#FFFFCC'), values(rnew),
                    na.color = 'transparent')

# Download and extract the Natural Earth data
download.file(
  file.path('http://www.naturalearthdata.com/http/',
            'www.naturalearthdata.com/download/10m/physical/ne_10m_lakes.zip',
            f <- tempfile())
unzip(f, exdir=tempdir())

# Read in the lakes shapefile    
lakes <- readOGR(tempdir(), 'ne_10m_lakes')

# Create a "land" shapefile by taking the difference between the 
# raster's extent and the lakes polys
land <- gDifference(as(extent(rnew), 'SpatialPolygons'), lakes)

# Mask rnew
rnew2 <- mask(rnew, land)

leaflet() %>% addTiles() %>%
  addRasterImage(rnew2, colors = pal, opacity = 0.4)

《在一个水体上移除部分光栅图像》

它并不完全遵循海岸线,但它并不太糟糕.

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