ggnet2：错误：每个变量必须是1d原子向量或列表

2023年6月1日 269次阅读

我正在尝试使用ggnet2来可视化网络分析,但是在插件中遇到了错误.

我可以生成随机网络,

library(ggnet2)
library(network)
library(sna)
library(ggplot2)

net = rgraph(10, mode = "graph", tprob = 0.5)
net = network(net, directed = FALSE)

# vertex names
network.vertex.names(net) = letters[1:10]

输出看起来合理

 >net
 Network attributes:
 vertices = 10 
directed = FALSE 
hyper = FALSE 
loops = FALSE 
multiple = FALSE 
bipartite = FALSE 
total edges= 28 
missing edges= 0 
non-missing edges= 28 

Vertex attribute names: 
vertex.names 

No edge attributes

但是,当我尝试运行..

ggnet2(net)

我收到一个错误

Error: Each variable must be a 1d atomic vector or list. Problem variables: 'x', 'y', 'xend', 'yend'

我不清楚这个错误是如何在小插图中出现的,因为net是一个列表,其中的所有变量都是列表.我已经检查过以确保我拥有所有必需的软件包,并且它们是最新的以及最新的R版本.

我刚试过ggnetwork,似乎得到了类似的错误.

有关为何出现此错误的任何想法？

最佳答案 错误消息说

Error: Each variable must be a 1d atomic vector or list. Problem 
variables: 'x', 'y', 'xend', 'yend'

如果您执行以下操作

library(ggnetwork)
net <- ggnetwork(net)
class(net$x)

你会发现x是一列矩阵.您的其他组件也是如此.这样做

net$x <- net$x[,1]
net$y <- net$y[,1]
net$xend <- net$xend[,1]
net$yend <- net$yend[,1]

将这些全部更改为1d原子向量和

ggplot(net, aes(x = x, y = y, xend = xend, yend = yend)) +
    geom_edges(aes(linetype = "directed"), color = "grey50")

应该管用.您可以阅读有关如何使ggnetwork适用于更漂亮的图表的更多信息.

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