R-基础分享【1】-基本命令及数据结构

这学期开了统计机器学习的课程,鉴于薄弱的概率论与统计学基础,学着还比较吃力,但是R语言的实践,还是令人兴趣十足。接下来的一段时间里,我便与大家分享我的R语言心得。

基本命令

  • 保存数据指令:<-

>x<-c(1,3,2,5)
>x
[1] 1 3 2 5

  • 删除数据指令:rm( )
    ls( )函数可以查看所有的对象列表,用rm( )函数可以去除那些我们不想要的对象。
    假设我们已建立了x,y

>ls()
[1] “x” “y”
>rm(x,y)
>ls()
character(0)

也可以同清除所有的对象:

>rm(list=ls( ) )

  • 展开帮助文件:?
    假如你现在在分析Boston数据集,他给你的是一个数据框,根据?Boston 你就会展开帮助文件,根据帮助文件,你可以知道这个数据集的数据来源,以及每列预测变量代表的含义。
  • 计算均值,方差与标准差
    均值mean( )
    方差var( )
    标准差sqrt(var( ) ) 或者 sd( )

>set.seed(3)
>y=rnorm(100)
>mean(y)
[1] 0.01103557
>var(y)
[1] 0.7328675
>sqrt(var(y))
[1] 0.8560768
>sd(y)
[1] 0.8560768

  • 索引数据
    在这个部分里讲如何索引数据,以及如何去除某一行,列的数据,矩阵的形成我们放到后面的数据结构中说明。

>A=matrix(1:16,4,4)
>A
  [,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 5 9 13
[2,] 2 6 10 14
[3,] 3 7 11 15
[4,] 4 8 12 16

然后输入以下命令

>A[2,3]
[1] 10

现在选择了第2行第3列所对应的元素,中括号[ ]中的第一个数指示的是行,第二个数指示的是列。有时候可以选择多行和多列。
在索引里用一个负号“-”告诉R不包含指示的行和列。

>A[-c(1,3),]
  [,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 2 6 10 14
[2,] 4 8 12 16
>A[-c(1,3),-c(1,3,4)]
[1] 6 8

dim()函数输出一个矩阵的行数,紧跟着输出这个矩阵的列数。

>dim(A)
[1] 4 4

数据结构

R语言中数据结构分向量,矩阵,数组,数据框,因子,列表 6种

向量

向量是用于存储数值型,字符型或逻辑型数据的一维数组。执行组合功能的函数c( )可用来创建向量。各类向量如下例所示:

  • a<-c(1,2,5,3,6,-2,4)
  • b<-c(“one”,”two”,”three”)
  • c<-(TRUE,TRUE,TRUE,FALSE,TRUE,FALSE)
    这里,a是数值型向量,b是字符型向量,而c是逻辑型向量。注意,单个向量中的数据必须拥有相同的类型或模式。同一向量无法混杂不同模式的数据。
  • 注:由于R中内置了同名函数c( ),最好不要在编码时使用c作为对象名,否则可能产生一些不易察觉的问题。

矩阵

矩阵是一个二维数组,只是每个元素都拥有相同的模式(数值型,字符型或逻辑型)。可通过函数matrix创建矩阵。一般使用格式为:
mymatrix<-matrix ( vector, nrow=number_of_rows, ncol=number_of_columns,
          byrow=logical_value,dimnames=list(
          char_vector_rownames , char_vector_colnames ) )

其中vector包含了矩阵的元素,nrow和ncol用以指示行和列的维数,dimnames包含了可选的、以字符型向量表示的行名和列名。byrow则表明矩阵应当按行填充(byrow=TRUE)还是按列填充(byrow=FALSE),默认情况下按列填充。

For Example:创建矩阵

创建一个5×4的矩阵
>y<-matrix(1:20,nrow=5,ncol=4)
>y
 [,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 6 11 16
[2,] 2 7 12 17
[3,] 3 8 13 18
[4,] 4 9 14 19
[5,] 5 10 15 20

创建一个2×2的矩阵,并进行按行填充
>cells<-c(1,26,24,68)
>rnames<-c(“R1″,”R2”)
>cnames<-c(“C1″,”C2”)
>mymatrix<-matrix(cells,nrow=2,ncol=2,byrow=TRUE,dimnames=list(rnames,cnames))
>mymatrix
  C1 C2
R1 1 26
R2 24 68
按列填充
>mymatrix<-matrix(cells,nrow=2,ncol=2,byrow=FALSE,dimnames=list(rnames,cnames))
>mymatrix
  C1 C2
R1 1 24
R2 26 68

数组

数组(array)与矩阵类似,但是维度可以大于2。数组可通过array函数创建,形式如下:

myarray<-array(vector , dimensions , dimnames)
其中vetor包含了数组中的数据,dimensions是一个数值型向量,给出了各个维度下标的最大值,而dimnames是可选的、各维度名称标签的列表。

For Example:创建数组

>dim1<-c(“A1″,”A2”)
>dim2<-c(“B1″,”B2″,”B3”)
>dim3<-c(“C1″,”C2″,”C3″,”C4”)
>z<-array(1:24,c(2,3,4),dimnames=list(dim1,dim2,dim3))
>z
, , C1

B1 B2 B3
A1 1 3 5
A2 2 4 6

, , C2

B1 B2 B3
A1 7 9 11
A2 8 10 12

, , C3

B1 B2 B3
A1 13 15 17
A2 14 16 18

, , C4

B1 B2 B3
A1 19 21 23
A2 20 22 24

数据框

数据框中不同的列可以包含不同模式(数值型,字符型等)的数据。数据框将是你在R中最常处理的数据结构。
数据框可通过函数data.frame( )创建:

mydata<-data.frame(col1, col2 ,col3 ,…)
其中的列向量col1,col2,col3,…可为任何类型(如字符型,数值型或逻辑型)。每一列的名称可由函数names指定。

For Example:创建数据框

>patientID<-c(1,2,3,4)
>age<-c(25,34,28,52)
>diabetes<-c(“Type1″,”Type2″,”Type1″,”Type1”)
>status<-c(“Poor”,”Improved”,”Excellent”,”Poor”)
>patientdata<-data.frame(patientID,age,diabetes,status)
>patientdata
  patientID age diabetes status
1      1 25   Type1  Poor
2     2 34   Type2  Improved
3      3 28   Type1  Excellent
4      4 52   Type1   Poor

选取数据框的数据在这里只介绍一个特别的,那些简单的就不一一介绍了。“$”,用以选取一个给定数据框中的某个特定变量

>patientdata$age
[1] 25 34 28 52

除了$符号,我们可以利用attach( ),detach( )和with( )函数来调用数据框中的数据。

  • attach( )和detach( )
    函数attach( )可将数据框添加到R的搜索路径中。R在遇到一个变量名以后,讲检查搜索路径中的数据框,以定位这个变量。
    举个例子,有如下代码:

summary(mtcars$mpg)
plot(mtcars$mpg,mtcars$disp)
plot(mtcars$mpg,mtcars$wt)

以上代码也可写成:

attach(mtcars)
  summary(mpg)
  plot(mpg,disp)
  plot(mpg,wt)
detach(mtcars)

  • with( )
    重写上例:

with(mtcars,{
 summary(mpg,disp,wt)
 plot(mpg,disp)
 plot(mpg,wt)
})

attach( )与with( )函数之间的区别,在这里不就说明。如需了解,可给我发简信。

因子

变量可归结为名义型,有序型或连续型变量。名义型变量是没有顺序之分的类别型变量。以上patientdata中糖尿病类型Diabetes(Type1,Type2)就是名义型变量的一类。即使在数据中Type1编码为1而Type2编码为2,但这并不意味着二者是有序的。病情Statu(poor,improved,excellent)是顺序型变量的一个示例。
类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中成为因子(factor)。

举例来说,有向量:
-diabetes<-c(“Type1” , “Type2” , “Type1” , “Type1” )
语句diabetes<- factor(diabetes)将此向量存储为(1,2,1,1),
并在内部关联为1=Type1 ,2=Type2。针对向量diabetes进行的任何分析都会将其作为名义型变量对待。

表示有序型变量,就要为函数factor( )指定参数ordered=TRUE。
status<- c(“Poor” , “Improved” , “Excellent” , “Poor”)
语句status<- factor(status,ordered=TRUE)会将向量编码为(3,2,1,3),
并在内部关联为1=Excellent,2=Improved,3=Poor。针对此向量进行的任何分析都会将其作为有序型变量对待。

对于字符型向量,因子的水平默认依据字母顺序创建。
你可以通过levels来覆盖默认排序
status<- factor(status, order=TRUE,
         levels=c(“Poor” , “Improved” , “Excellent” ) )
赋值为 1=Poor,2=Improved, 3=Excellent。

For Example:因子的使用

>patientID<-c(1,2,3,4)
>ge<-c(25,34,28,52)
>status<-c(“Poor”,”Improved”,”Excellent”,”Poor”)
>diabetes<-c(“Type1″,”Type2″,”Type1″,”Type1”)
>status<-factor(status,ordered=TRUE)
>patientdata<-data.frame(patientID,age,diabetes,status)
>str(patientdata)
‘data.frame’: 4 obs. of 4 variables:
$ patientID: num 1 2 3 4
$ age : num 25 34 28 52
$ diabetes : Factor w/ 2 levels “Type1″,”Type2”: 1 2 1 1
$ status : Ord.factor w/ 3 levels “Excellent”<“Improved”<..: 3 2 1 3
>summary(patientdata)
  patientID    age        diabetes   status
Min. :1.00    Min. :25.00    Type1:3   Excellent:1
1st Qu.:1.75   1st Qu.:27.25   Type2:1   Improved :1
Median :2.50   Median :31.00         Poor :2
Mean :2.50    Mean :34.75
3rd Qu.:3.25   3rd Qu.:38.50
Max. :4.00    Max. :52.00

  • str(object)可提供R中某个对象的信息。

列表

列表(list)是R的数据类型中最为复杂的一种。列表就是一些对象的有序集合。通俗的说,就是某个列表中可以是若干向量、矩阵、数据框,甚至其他列表的组合。
可用list( )创建列表
mylist<- list (object1 , object 2,…)
还可以为列表中的对象命名:
*mylist<- list(name1=object1, name2=object2, …)

For Example:创建一个列表

> g<-“My Fist List”
>h<-c(25,26,18,39)
>j<-matrix(1:10,nrow=5)
>k<-c(“one”,”two”,”three”)
>mylist<-list(title=g,ages=h,j,k)
>mylist
$title
[1] “My Fist List”

$ages
[1] 25 26 18 39

[[3]]
  [,1] [,2]
[1,] 1 6
[2,] 2 7
[3,] 3 8
[4,] 4 9
[5,] 5 10

[[4]]
[1] “one” “two” “three”

了解了基本命令和各种数据的创建,就可以运用R做一些简单的运算,一个庞大的数据放在你面前,你真的会不知所措,但是通过R,你可以发现其中的奥秘。欢迎大家和我一同学习R语言。

  • 本文中的代码来自于 R语言实战 R in Action。
    原文作者:CharlesSun9
    原文地址: https://www.jianshu.com/p/83de8d0e3a8e
    本文转自网络文章,转载此文章仅为分享知识,如有侵权,请联系博主进行删除。
点赞