Pythonic方式取代chars

2019年8月4日 160次阅读

我想用
pythonic方法替换字符串中的一些字符.

A -> T
C -> G
G -> C
T -> A

例：

AAATCGATTGAT

将转变为

TTTAGCTAACTA

我做了什么：

def swap(string):
    string = re.sub('A', 'aux', string)
    string = re.sub('T', 'A', string)
    string = re.sub('aux', 'T', string)
    string = re.sub('C', 'aux', string)
    string = re.sub('G', 'C', string)
    string = re.sub('aux', 'G', string)

    return string

它工作得很好,但我正在寻找一种更加pythonic的方法来实现这一目标.

最佳答案 使用带有理解和str.join的字典：

translateDict = {
  "A" : "T",
  "C" : "G",
  "G" : "C",
  "T" : "A"
}

s1 = "AAATCGATTGAT"
reconstructed = "".join(translateDict.get(s, s) for s in s1)

在这里你有live example

注意使用dict.get;如果字母不在字典中,我们只是按原样放过它.

正如@ bravosierra99建议的那样,你也可以简单地使用str.translate：

reconstructed = s1.translate(string.maketrans(translateDict))
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